目前来看，IC卡行业发展主要存在四大阻碍。其一，卡片的限制。在IC卡规划中，一张卡可以集成多个行业应用，在不同的场合分别使用IC卡中的相应区域。但是，目前IC卡本身的技术尚未达到像电脑安装软件一样的随心所欲，要实现众多功能需要有个前提，那就是制作卡片时需要确定在卡片中应放置哪些行业应用，而这些行业应用不能在发卡或发卡之后再随时的添加。
这个问题在IC卡推广初期问题不大，大部分客户申请的IC卡都或多或少带着一两个行业应用，但当各个行业都开始推广使用IC卡时，IC卡的泛滥将成为一个非常严重的问题。
其二，协议的限制。这包括两个方面，一是支付流程的不可更改性，导致IC卡应用支付时无法将这些操作与支付请求放入同一个原子交易中，难以进行有效判断；二是没有冲正操作，导致钱扣错了不能回滚交易，只能以现金返还。
其三，无统一发展规划，重复建设浪费严重。IC卡的特性决定了其广泛的应用领域和一卡多用、一卡多能发展前景，由于没有形成统一协调各个行业的机制，造成行业应用举步维艰。各行业重复建设，资源投入，技术研发，系统维护浪费严重。而且各行业重复发卡，不仅未给广大居民带来便利，反而形成了“怀揣多卡”的新麻烦。
其四，尚未形成成熟的商业模式。IC卡的跨行业应用是最重要的发展方向。以金融IC卡为例，在银行卡由磁条卡向IC卡迁移过程中，银行卡具备进入某些行业支付应用领域的条件，但由于各行业诉求不一，利益关系复杂，在金融IC卡进入初期通常会遇到很多困难，因此，行业合作过程中，既要争取行业统一的指导和支持，又需要尊重市场规律，根据行业特点探索建立成熟的商业模式，平衡各方利益诉求，才能取得成功。
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